日光岩寺位于鼓浪屿全岛制高点日光岩脚下,估证始建于明正德年间,初名“莲花庵”,明万历十四年（公元1586年）重修,更名为日光岩寺。
此后历经多次翻修增建,形成现今规模,占地面积2800多平方米,建筑面积2000多平方米。
寺庙主殿名为圆通宝殿,是全寺最古老的建筑,其主体为凿空山顶巨石而成的一间石室,坐西向东,朝向海上日出的方向。
室内石梁上还保留着“莲花庵”的题刻。寺庙建筑组群小巧别致,布局不拘泥于常法,随山就势,凿岩为室,将自然的时空变换与佛学思想相融合,形成独到的景观特色。
19世纪中期以后,鼓浪屿虽然受到西方宗教的影响,但以日光岩为代表的鼓浪屿传统佛教文化并未衰落,它甚至一度发展成为闽南地区有相当影响的佛教寺院。
1936年,弘一法师曾在寺中东厢寮房闭关养静,期间编订了多部佛学著作,并为其静修的房舍题匾,称为“日光别院”。
